Учні, які навчаються в Криворізької гімназії № 49 , можуть поглибити свої знання, відвідуючи спецкурси та факультативи згідно з обраним профілем, заняття Школи олімпійського резерву, відділення наукового товариства, беручи участь в інтелектуальних конкурсах।
З २००५ року в гімназії діє товариства учнів "Інтелект"। Згідно з планом роботи товариства проводиться засідання учнівської наукової ради спільно з учителями-наставниками। Ці заняття дають можливість поділитися із слухачами товариства набутою інформацією щодо написання наукової роботи, створенню проектів, допомогти молодшим учням якісно підготувати творчо-пошукову або дослідницьку роботу та її захист।
За час діяльності товариства підвищилась активність включення учнів у науково-дослідницьку діяльність, самостійність в підборі науково-популярної літератури, проведенні досліджень, обгрунтуванні отриманих результатів, підготовці презентації науково-дослідницької роботи або проекту।
власні творчо-пошукові дослідження гімназисти презентують на щорічній науково- практичній конференції в рамках "Дні науки і творчості", яка проводиться всічні, а в травні за підсумками творчих досягнень проводиться конкурс "Гімназист року", де нагороджуються учні грамотами і разовими стипендіями। у २०१०-२०११ року учнями гімназії створено २२ проекти з різних предметів।
З २००७ року на базі гімназії проводиться міський конкурс твоорчо-пошукових робіт з геометрії "Студія геометричних ідей", де наші учні гімназії щороку демонструють творчий підхід, дослідницькі наробки।
Гордість гімназії є обдаровані діти, які є багато разовими переможцями в олімпіадах та інтелектуальних конкурсах: Тригуба Роман, учень ७-го класу,переможецьобласного етапу конкурсу з української мови ім। п। Яцика та учасник Всеукраїнського 2009р।, Глобіна Марія, учениця १० класу, дворазова переможниця міського конкурсу з математики, Кузьміна Олександра, Ковалик Юлія, Василець Валерія, Сивак Олена, Жержерунова Анастасія - триразові переможці міських олімпіад, Усата марія, Коркошук Євгенія, Самсоненко Світлана, Савосько Віра є переможцями обласного етапу Всеукраїнського конкурсу - захисту науково-дослідницьких робіт з фізикики, екології, української мови, медицини ДВ МАН україни (२००९-2010рр.)